Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRCP08575 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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