Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLK3P07288 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLK3P07288 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms