Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F9P00740 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F9P00740 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F9P00740 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F9P00740 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F9P00740 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
F9P00740 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F9P00740 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms