Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL3O95164 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL3O95164 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms