Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP6O75581 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP6O75581 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP6O75581 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms