Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A3O75365 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A3O75365 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A3O75365 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A3O75365 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A3O75365 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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