Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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