Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms