Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLGNO14967 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLGNO14967 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms