Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPA5E9PKD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms