Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B4DGG1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DGG1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DGG1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DGG1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms