Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SOBPA7XYQ1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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