Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTLL13PA6NNM8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTLL13PA6NNM8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms