Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RGPD3A6NKT7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms