Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB13A6NJU9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NPIPB13A6NJU9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NPIPB13A6NJU9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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