Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms