Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP73A6NFT4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms