Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF22A3QJZ6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms