Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
V9GYV3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
V9GYV3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
V9GYV3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
V9GYV3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
V9GYV3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
V9GYV3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
V9GYV3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
V9GYV3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms