Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54L2Q9Y4B4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54L2Q9Y4B4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms