Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms