Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPRKBQ9Y3C4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms