Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP3Q9Y2W1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP3Q9Y2W1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms