Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MGAT4AQ9UM21 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms