Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms