Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHORDC1Q9UHD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms