Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms