Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTSFQ9UBX1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms