Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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