Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM8A1Q9UBU6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms