Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRBP1Q9P2E9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms