Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms