Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAMSAP3Q9P1Y5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms