Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms