Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms