Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms