Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms