Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms