Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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