Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms