Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms