Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPJQ9HC77 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPJQ9HC77 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms