Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms