Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms