Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC8Q9BY41 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms