Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RSPO3Q9BXY4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms