Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms