Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms