Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms