Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD2Q9BSE4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms